Идет набор

    Проект: Разработка приложения-анализатора состояния объектов интереса на медицинских изображениях.

    Аннотация проекта:
    В рамках проекта предполагается разработать прототип программы анализа состояния объектов интереса на изображениях формируемых медицинскими оптическими системами. Оптические методы получения медицинского изображения основаны на использовании света и оптических технологий для визуализации внутренних структур организма. К основным оптическим методам получения медицинского изображения относятся: микроскопические изображения; оптическая когерентная томография (ОКТ); лазерная диффузионная томография; лазерная когерентная томография; диффузное оптическое изображение; флюоресцентная диагностика; эндоскопическое изображение; лазерная допплеровская флоуметрия. Современные инженеры-разработчики решаю ряд задач, для развития современной области телемедицины, но ввиду обширности систем формирования медицинских изображений и областей их использования остается много нерешенных задач. В частности создание автоматизированных приложений анализа состояния объектов интереса (ткани, органы человека, сосуды и т.д.) на медицинских изображениях имеет большие перспективы. Проект направлен на создание прототипа программного обеспечения позволяющего распознавать и классифицировать объекты интереса на медицинском изображении, после осуществлять его аналитику (например: сравнение с базой здоровых органов и тканей), а так же выдавать информацию о состоянии объекта интереса. В рамках проекта будет изучена специфика применения и интеграции современных достижений в области анализа изображений (например: методы и алгоритмы повышения качества исходных изображений; сверточные нейронные сети; методы и алгоритмы отслеживания траекторий движения объектов), в область телемедицины. Цель проекта - разработать прототип приложения анализатора состояния объектов интереса на медицинских изображениях. В рамках проекта планируется решить ряд задач: 1. Изучить современные решения в области обработки и анализа медицинских изображений. 2. Обучить модель нейронной сети осуществляющей распознавание определенных объектов (органы, кости, ткани человека) на медицинских изображениях. 3. Разработать алгоритмы сравнения и оценки отклонений на объектах интереса. 4. Разработать прототип программного обеспечения готового к функциональному тестированию, для последующей доработки и расширения функционала.
    Партнер проекта:

    ФГАОУ ВО ТУСУР

    ТУСУР – признанный лидер в сфере подготовки квалифицированных кадров для высокотехнологичных отраслей экономики, аэрокосмического и оборонного комплексов страны, внедряющий инновационные образовательные и исследовательские программы, прикладные разработки новой техники, аппаратуры и систем управления. Университет уверенно держит первенство в реализации программ инновационного развития. Выпускники ТУСУРа составляют кадровую основу многих предприятий как в России, так и за рубежом.

    Вакансии:
    ПрограммистПрограммистПрограммистКуратор проекта
    Классификация работы:
    НИР прикладная
    Направление исследований и разработок:
    Н1. Цифровые технологии

    Конечный продукт

    В результате планируется получить прототип программного обеспечения (ПО) осуществляющего идентификацию объектов интереса на различных медицинских изображениях и осуществляющего их аналитику. Данный прототип позволит осуществить функциональное тестирование и последующую доработку, для дальнейшей продажи уже готового программного обеспечения. В функционал прототипа ПО будет включено: - возможность идентифицировать суставы кисти человека, с последующей оценкой траекторий их движений, для выявления износа сустава и отклонений от нормы; - возможность идентификации объектов в области простаты человека, с последующим анализом их состояния; - возможность распознавания объектов интереса на томаграфических снимках. Так же будет подготовлен комплект пользовательской документации, для проведения полноценного функционального тестирования. В рамках научной деятельности планируется подготовка ряда научных публикаций: 2 статьи в журналах из перечня ВАК (К1); 1 статья в журнале индексируемом в базах данных MathSciNet, Scopus. Так же планируется участие в 3-х конференциях в том числе в одной под эгидой общества IEEE.

    Актуальность и востребованность

    В последнее время одним из актуальных направлений развития компьютерных технологий в медицине становится обработка цифровых изображений: улучшение качества изображения, восстановление поврежденных изображений, распознавание отдельных элементов. Распознавание патологических процессов является одной из наиболее важных задач обработки и анализа медицинских изображений. При решении задач распознавания все чаще используются компьютерные системы диагностики – computer aided diagnostic (CAD). Алгоритм CAD – системы медицинских изображений, как правило, включает в себя сегментацию изображения, выделение объектов интереса («масс»), их анализ, параметрическое описание, их классификацию. При этом выделенные объекты являются отражением патологического процесса в организме, а их классификация отвечает на вопрос, все ли выделенные объекты являются проявлением патологического процесса. В качестве методов параметрического описания выделенных объектов используется текстурный, гистограммный и морфометрический анализ, однако сочетание этих методов применяется редко. Классификация объектов интереса проводится по методу нейронных сетей, опорных векторов, дискриминантного анализа и пр. Вместе с тем задача автоматизированной диагностики патологических процессов по данным медицинских изображений далека от своего разрешения. Актуальной проблемой остается определение оптимальных методов параметрического описания объектов интереса, что может оказывать непосредственное влияние на качество их классификации. Интерпретация медицинских изображений представляет сложности как для врача, так и для искусственного интеллекта. Трудности для врача: - специалисты могут разойтись в диагнозе при оценке одного и того же снимка; - ряд заболеваний на ранних стадиях проявляется небольшими изменениями, которые можно пропустить при визуальном осмотре; - врачу необходимо просмотреть большее число снимков, часто сравнивая их с предыдущими исследованиями; - время частично затрачивается на подготовку отчётов. Трудности для искусственного интеллекта (ИИ): - Архивы медицинских снимков, которые представляют собой наборы данных, изначально непонятны компьютеру. Они нуждаются в предварительной обработке. Медицинские специалисты вручную маркируют каждый снимок, просматривая его на наличие патологии и указывая диагноз. Процесс может занять длительное время и зависит от опыта диагноста. - ИИ может демонстрировать высокую точность на ограниченном наборе данных, но ошибаться в случае новых примеров. Исследователи стараются, чтобы алгоритм был обобщаемым и демонстрировал эффективность в разных клинических ситуациях. - Разнородность данных обусловлена особенностями диагностической аппаратуры. Марка и модель сканера, который использовался при исследовании, может отразиться на качестве снимка. Гетерогенность данных также объясняется опытом оператора, разными параметрами сканирования, а также разнообразием групп пациентов – пол, возраст, заболевание. Актуальность разработки современных решений в области анализа цифровых фото и видеоданных подтверждается тем, что в 2019 году объем российского рынка компьютерного зрения оценивался в 8 миллиардов рублей, то к концу 2023 года он может достигнуть 38 миллиардов. Согласно опросу TAdviser, самыми перспективными отраслями для компьютерного зрения считаются видеонаблюдение и безопасность - их назвали 28 процентов респондентов. Столько же у медицины и здравоохранения. Далее следуют транспорт и производственный сектор - по 16 процентов. На видеоаналитику самый большой спрос (17 процентов заявок) у туристического сектора, сферы культуры и досуга. В лидерах также промышленность, строительство и коммерческая недвижимость (11-15 процентов). Так же можно отметить что применение ИИ в области здравоохранения интегрируется как базовая технология и включается во многие стратегии развития.

    Предмет разработки/исследования

    Предметом исследования данного проекта являются современные методики и алгоритмы обработки и анализа изображений. На их базе планируется разработка новых методик обработки, а так же возможно усовершенствование уже существующих решений согласно области реализации проекта. Так же разработке подлежит новый программный продукт для идентификации и анализа состояния объектов интереса на медицинских изображениях.

    Способы и методы реализации проекта

    В рамках реализации планируется проведении аналитического обзора современного состояния предметной области проекта. На базе полученных в ходе обзора результатов будет проведено практической исследование найденных результатов с их последующим анализом. На базе полученных данных будет выполнена реализация алгоритмов обработки медицинских изображений. После чего буду реализованы алгоритмы анализа обработанной информации для идентификации объектов интереса и анализа их состояния. При выполнении аналитического обзора современного состояния предметной области проекта, участники с низким изначальным уровнем понимания решаемых задач смогут в полной мере погрузиться в их решение за счет расширения своих знаний. В то время как участники с большим опытом смогут его расширить и отслеживать современные тенденции развития предметной области реализации проекта. Практическое исследование найденных в ходе аналитического обзора решений позволит получить понимание их пригодности для решения поставленных задач, а так же получить практические навыки по обработке и анализу информации на цифровых медицинских изображениях. На следующих этапах будут получены навыки самостоятельного поиска решений, анализа полученных результатов, навыков по модернизации существующих решений и навыки программной реализации средств обработки и анализа цифровых медицинских изображениях. Таким образом, обучающиеся ПИШ смогу коснуться различных методов решения поставленных задач и получить большой опыт их решения с различных сторон.

    Новизна предлагаемых в проекте решений

    В части решаемых задач в проекте планируется использовать новые быстродействующие алгоритмы обработки изображений, например, рекурсивно-сепарабельные фильтры. Они за счет своей внутренней структуры позволяют сократить количество вычислительных операций, требуемых на процесс обработки. Так же разработка и обучение нейронных сетей для решения различных задач с каждым годом получается все больше распространения для решения задач в различных областях науки и техники. Например, фирмы, занимающиеся разработкой систем анализа визуальной информации, которые работают в режимах, приближенных к реальному времени (компьютерное зрение). Если в 2019 году объем российского рынка компьютерного зрения оценивался в 8 миллиардов рублей, то к концу 2023 года он может достигнуть 38 миллиардов. Согласно опросу TAdviser, самыми перспективными отраслями для компьютерного зрения считаются видеонаблюдение и безопасность - их назвали 28 процентов респондентов. Столько же у медицины и здравоохранения. Далее следуют транспорт и производственный сектор - по 16 процентов. На видеоаналитику самый большой спрос (17 процентов заявок) у туристического сектора, сферы культуры и досуга.

    Задел по тематике проекта

    В рамках задела, коллектив проекта принимал участие в выполнение работ по 10 различным проектам, в которых выполнялась разработка новых методик и алгоритмов цифровой обработки и анализа изображений, в частности руководителем защищена кандидатская диссертация по быстродействующим цифровым фильтрам. Опубликована монография: Современные методы анализа и повышения качества цифровых изображений : монография / С. В. Сай, А. В. Каменский, М. И. Курячий ; Министерство науки и высшего образования Российской Федерации, Тихоокеанский государственный университет. – Хабаровск : Изд-во Тихоокеан. гос. ун-та, 2020. – 173с. В рамках индивидуального проекта по стипендии Президента РФ, проводились исследования и разработка решений по диагностики подвижности сустава в кисти человека. Следует отметить опыт разработки программ для ЭВМ, за последние 4 года было получено 11 свидетельств о государственной регистрации программ для ЭВМ и баз данных. Коллективом опубликовано более 100 публикаций различного уровня (Каменский А.В. https://elibrary.ru/author_profile.asp?id=1057825 и Капустин В.В. https://elibrary.ru/author_profile.asp?id=897739), в том числе имеются работы по обработке и анализу информации на медицинских изображений, из них ряд статей с высоким статусом (Q2).

    Конкурентные преимущества создаваемого продукта

    Несмотря на широкое распространение нейронных сетей в мире, каждая решает определенные задачи. Их все активнее начинают использовать в сфере высокотехнологичной медицины, но они решают определенные задачи на которых сконцентрированы разработчики. Преимуществом разрабатываемых решений будут модели нейронных сетей обученные именно для решения специфических задач в области идентификации и анализа состояния объектов интереса на медицинских изображениях. Так же к преимуществам можно отнести тот факт что разрабатываемый прототип ПО позволит сделать его функционал гибким за счет интеграции в него различного функционала анализа различных оптических изображений формируемых различными медицинскими комплексами.

    Календарный план

    1 этап:
    Анализ существующих решений
    Продолжительность:
    3 месяца
    Работы, выполняемые на этапе:
    Отслеживание текущего состояния области реализации проекта, для выявления новых разработок и технологий, расширяющих возможности реализации проекта или конкурирующих с результатами достигаемыми в проекте, как в России так и за рубежом.
    Результаты выполнения этапа:
    Отчет с анализом современного состояния и тенденций развития предметной области.
    2 этап:
    Интеграция готовых решений
    Продолжительность:
    6 месяцев
    Работы, выполняемые на этапе:
    Реализация и тестирование существующих решений.
    Результаты выполнения этапа:
    Часть отчета с обширным практическим исследование. Перечень рекомендации по использованию или усовершенствования существующих решений.
    3 этап:
    Усовершенствование и разработка новых методик
    Продолжительность:
    6 месяцев
    Работы, выполняемые на этапе:
    Реализация усовершенствованных и разработанных методик связанных с определённой решаемой задачей проекта.
    Результаты выполнения этапа:
    Теоретические и практические результаты реализации и анализа предложенных решений.
    4 этап:
    Завершение работ по поставленным задачам
    Продолжительность:
    6 месяцев
    Работы, выполняемые на этапе:
    Итоговая реализация паротита программного обеспечения. Подготовка пользовательской документации.
    Результаты выполнения этапа:
    Отчет подтверждающий решение поставленных задач.

    Команда проекта

    Руководитель проекта

    Каменский Андрей Викторович

    Инженерно-технический персонал

    • Куратор проекта

      Капустин Вячеслав Валериевич

      Должность: Доцент каф. ТУ

      Опыт и квалификация: Доцент кафедры ТУ, заведующий лабораторией телевизионной автоматики (каф. ТУ). Кандидат технических наук (год присвоения 2017).

    Вакансии для обучающихся

    Идет набор

    Программист

    1. Знание основ цифровой обработки изображений. 2. Знание принципов формирования и обработки сигналов. 3. Знание языков программирования.

    Идет набор

    Программист

    1. Знание основ цифровой обработки изображений. 2. Знание принципов формирования и обработки сигналов. 3. Знание языков программирования.

    Идет набор

    Программист

    1. Знание основ цифровой обработки изображений. 2. Знание принципов формирования и обработки сигналов. 3. Знание языков программирования.

    Идет набор

    Куратор проекта

    1. Знание принципов работы проектных команд. 2. Уверенное владение Русским (желательно и Английским) языком. 3. Умение работать с текстовыми документами, которое включает в себя знание стандартов и ГОСТов.

    Дополнительные материалы

    • Статья обработка изображений

      460418.pdf